Biologinio pavojingo maišo naudojimas apima standartizuotas procedūras ir geriausias praktikas, skirtas užtikrinti saugų biologinio pavojingo šiukšlių laikymą, tvarkymą ir pašalinimą, mažinant riziką žmonių sveikatai ir aplinkai. Pirmasis tinkamo naudojimo žingsnis yra tinkamo maišo tipo pasirinkimas pagal atliekų kategoriją: infekcinėms atliekoms (pvz., užteršti pirštinės, tampurai) pakanka standartinio 4 mil HDPE biologinio pavojingo maišo; aštriam atliekoms (pvz., adatų, skalpelius) reikalingas storesnis 6 mil prieš pradurimą atsparus maišas su sustiprintu dugnu; skystoms ar pusiau skystoms atliekoms (pvz., kraujui, ląstelių kultūrų terpėms) būtinas nesunkus maišas su patikimu karščiu sandariai uždaromu uždarymu. Prieš naudojimą vartotojai turi patikrinti maišą dėl bet kokių defektų, tokių kaip plyšiai, skylės ar silpnos vietos – pažeisti maišai turi būti nedelsiant išmesti, kad nebūtų nutekėjimo. Pripildant maišą, būtina vengti perpildymo, nes tai gali pažeisti maišo konstrukcinį vientisumą. Rekomenduojamas pripildymo lygis neturi viršyti dviejų trečdalių maišo talpos, kad būtų galima lengvai užsandarinti be medžiagos tempimo. Pildymo metu vartotojai turi dėvėti tinkamą asmeninę apsaugos įrangą (PPE), įskaitant nitrilines pirštines, veido kaukę ir laboratorinį chalatą, kad būtų išvengta tiesioginio kontakto su pavojingomis medžiagomis. Užpildžius maišą, jį būtina tinkamai užsandarinti: maišams su virvutėmis naudokite patikimą mazgą ir pridėkite antrą virvutę 5 cm virš pirmosios, kad būtų sukurtas dvigubas sandarumas; maišams su užtrauktukais užtikrinkite, kad užtrauktukas būtų visiškai uždarytas, ir paspauskite palei visą ilgį, kad patvirtintumėte glaudų sandarumą; maišams, kurie užsandarinami karščiu, naudokite karščiu užsandarinantį prietaisą, nustatytą gamintojo rekomenduojama temperatūra (paprastai 180–200 °C), kad būtų sukurtas nuolatinis, nesunkus sandarumas. Užsandarinus maišą, jis turi būti pažymėtas būtina informacija, įskaitant surinkimo datą, atliekų tipą (pvz., „Infekcinės atliekos“), skyriaus arba objekto pavadinimą bei asmens, atsakingo už surinkimą, vardą. Pažymėti maišai tada turi būti pervežti į specialiai skirtą biologinio pavojingo atliekų saugojimo vietą – ši vieta turi būti gerai vėdinama, užrakinta ir pažymėta biologinio pavojingo simboliu bei atskirta nuo bendrųjų atliekų saugojimo vietų. Saugojimo trukmė neturi viršyti 72 valandų vidutinėse klimato sąlygose, kad būtų užkirstas kelias mikroorganizmų dauginimuisi. Galutinis sunaikinimas priklauso nuo vietinių taisyklių: dažniausiai naudojamos metodikos apima sudeginimą licencijuotame įrenginyje (infekcinėms ir patologinėms atliekoms) arba autoklavavimą (atliekoms, kurios prieš išmetimą gali būti sterilizuojamos). Realus taikymo pavyzdys – diagnostikos laboratorija, kuri įdiegė griežtą biologinio pavojingo maišo naudojimo protokolą COVID-19 tyrimų mėginiams tvarkyti. Mokydama personalą tinkamai parinkti, pildyti, užsandarinti ir žymėti maišus, laboratorija visiškai panaikino mėginių nutekėjimus pervežant juos į atliekų sunaikinimo įrenginį, užtikrindama atitiktį CDC nurodymams. Organizacijoms, norinčioms sukurti arba tobulinti savo biologinio pavojingo maišo naudojimo procedūras, labai svarbu turėti išsamią mokymo medžiagą ir produkto gaires, o susidomėjusios šalys gali kreiptis į mus dėl individualios paramos ir išteklių.